Das Hauptziel des Eco-Schools-Programms ist es, dass die Schulen nach und nach eine Dynamik der Bildung für Nachhaltige Entwicklung in ihr Schulleben integrieren. Die Schülerinnen und Schüler erwerben dadurch die notwendigen Kompetenzen, um die Herausforderungen der Welt um sie herum anzugehen und eine zukunftsfähige Entwicklung mitzugestalten.
Das Eco-Schools-Programm befähigt die Lernenden, sich aktiv und selbstbestimmt an Gestaltungsprozessen für eine nachhaltige Entwicklung an ihrer Schule zu beteiligen. So werden die Schülerinnen und Schüler zu einer neuen Generation von verantwortungsvollen Bürgerinnen und Bürgern, die sich für die Erhaltung der Umwelt, soziale Gerechtigkeit und wirtschaftliches Wohlergehen überall auf der Welt engagieren.
Das Eco-Schools-Programm ermöglicht somit eine ganzheitliche Arbeit an den vier Säulen der Bildung: dem Lernen zu wissen, Lernen zu sein, Lernen zu handeln und Lernen zusammenzuleben. Es unterstützt die Schülerinnen und Schüler beim Erwerb von Kompetenzen wie dem kritischen und vernetzten Denken, der Kreativität, der Kooperation und der Verantwortung.